С V века в Греции, с 1174 года и на Руси архимандриты были настоятелями самых крупных монастырей.

В Казанской епархии монастыри Казанский Спасо-Преображенский и Свияжский Успенский возглавлялись архимандритами. Первые казанские архимандриты – Варсонофий и Герман. С XVIII века архимандритами становились ректоры, профессора духовных учебных заведений (семинарий, академий) и др.

Обычно архимандриты являлись первыми кандидатами для посвящения в сан епископа.