Расположен в здании, построенном в 1837 г. по проекту архитектора М.П.Коринфского специально для физико-химической лаборатории университета. Коллекции музея отражают историю развития Казанской химической научной школы с середины XIX в. Площадь музея 310 м2, фонды включают более 6 тыс. единиц хранения.

Начало созданию коллекций музея положил К.К.Клаус, работавший в лаборатории и впервые получивший 6-й элемент платиновой группы рутений и некоторые соединения платиновых металлов. Хранителями музея работали многие знаменитые учёные: А.Н.Попов, С.Н.Реформатский, И.И.Канонников, И.В.Сорокин и др. В музее сохранены интерьеры, мебель и оборудование лаборатории XIX в., учебная аудитория, кабинет и научная библиотека А.М.Бутлерова, библиотека лаборатории. Среди экспонатов — вещества, впервые полученные казанскими учёными: синтетический анилин (Н.Н.Зинин), триметилкарбинол, первый из класса третичных спиртов (А.М.Бутлеров) и другие препараты, синтезированные выдающимися представителями Казанской химической научной школы В.В.Марковниковым, М.М.Зайцевым, Е.Е.Вагнером, Ф.М.Флавицким, С.Н.Реформатским, А.Е. и Б.А.Арбузовыми и др. В собрании музея — книги казанских химиков с автографами, их бюсты и портреты, документы лаборатории с 1837 г. по 1900 г., стеклянная химическая посуда, собственноручно изготовленная А.Е.Арбузовым для опытов.

Развёрнута постоянная экспозиция, посвященная истории создания и деятельности Химического института им. А.М.Бутлерова, открытого в 1929 г. по решению 5-го Менделеевского съезда в связи со 100-летием со дня рождения учёного. Проводятся экскурсии, посвященные истории органической химии. Музей внесён в путеводитель европейских музеев по истории химии и фармации. На его здании установлено 9 мемориальных досок в честь учёных Казанской химической научной школы.

Начиная с середины XX в. должность заведующий музеем исполняли сотрудники Химического института им. А.М.Бутлерова В.М.Зороастрова (1950–1980), В.С.Виноградова (1980–1992), А.В.Фуженкова (1992–1998); с 1999 г. — Т.Д.Сорокина. 

Литература            

По музеям университета: Буклет. [Б. м.], [Б. г.].                

Автор — Т.Д.Сорокина