Открыта в 1998 г. как высшее учебное заведение Казанской епархии Русской православной церкви. Занимается подготовкой православных священнослужителей и преподавателей богословских дисциплин. При семинарии действуют пастырско-богословское и регентское отделения; 7 кафедр (богословия и философии, библеистики, общей и церковной истории, церковно-практических дисциплин, филологии, исламоведения, церковно-певческих и музыкальных дисциплин) в составе 52 преподавателя и около 80 студентов. Печатные издания: «Православный собеседник», «Семинарский вестник».

Ректоры: Анастасий (Меткин) (1998–2014 гг.), Евфимий (Моисеев) (2014–2015 гг.), Феофан (Ашурков) (с 2015 г.).