Родился 1 января 1963 г. в селе Янгулово Балтасинского района Татарской АССР.

Окончил исторический факультет Казанского университета (1985 г.), с 1985 по 1988 гг. работал учителем истории и обществоведения. В 1988–1991 гг. – аспирант, 1990–1992 гг. – научный сотрудник отдела истории ИЯЛИ им. Г.Ибрагимова КНЦ.

В 1992 г. И.К. Загидуллин защитил кандидатскую диссертацию по теме «Татарские крестьяне Казанской губернии (60–90-е гг. XIX в.)» в Казанском университете. Научный руководитель – доктор исторических наук З.И. Гильманов.

В 1993–1995 гг. И.К. Загидуллин – директор Татарского государственного колледжа, в 1996 г. – ректор Татарского государственного колледжа, в 1997 г. – ректор, с августа 1997 г. по август 1998 г. – проректор по научной работе Татарского государственного гуманитарного института. Под его руководством в вузе были сформированы факультеты и кафедры, налажено обучение по специальностям «Татарский язык», «Английский язык», «История», «Педагогика», «Методика начального образования».

В 1998–2014 гг. – заведующий отделом средневековой истории, в 2015–2021 гг. – заведующий отделом новой истории Института истории им. Ш.Марджани, в 2021–2022 гг. – главный редактор научно-документального журнала "Гасырлар авазы – Эхо веков".  С 2022 г. в Центре исламоведческих исследований Академии наук РТ. 

В 2006 г. И.К.Загидуллин защитил в Институте истории им. Ш.Марджани докторскую диссертацию по теме «Положении ислама в России: исламское богослужение и мечети в европейской части России и Сибири (последняя треть XVIII – начало ХХ в.)».

И.К.Загидуллин, будучи заведующим отдела средневековой истории, руководил подготовкой I, II, VI томов семитомной «Истории татар с древнейших времен» (2002, 2006, 2013).

Под его научной редакцией публикуются труды из серий «Исторические судьбы народов Поволжья и Приуралья» и «Исламские институты в Российской империи».

И.К.Загидуллин ведет большую научно-организационную работу. Он создатель и главный редактор журналов «Из истории и культуры народов Среднего Поволжья» и «Средневековые тюрко-татарские государства» (с 2015 г.), член редколлегии журналов «Научный Татарстан» (с 2008 г.), «Исторический поиск» (с 2020 г.), редактор отдела по истории журнала «Фәнни Татарстан» (с 2014 г.); руководитель (2014–2015 гг.) и член (с 2015 г.) Научно-консультативного совета при Государственном комитете Республики Татарстан по архивному делу, член отраслевой научной редакционной коллегии Татарской энциклопедии.

И.К. Загидуллин – инициатор и организатор всероссийских конференций, посвященных различным аспектам истории и источниковедения постзолотоордынских тюрко-татарских государств (2008–2014 гг.), под его научным руководством проводятся Всероссийские научные форумы «Исторические судьбы народов Поволжья и Приуралья» (с 2009 г.).

Член диссертационных советов по истории Института истории им. Ш.Марджани (2006–2014 гг.), Казанского университета (2008–2009, 2017–2019 гг.).

И.К.Загидуллин – известный ученый в области истории татар нового времени. Имеет более 400 публикаций. Основные направления научной деятельности:

• реализация в Российской империи религиозных прав татар-мусульман в традиционных общинах и правительственных учреждениях («Мусульманское богослужение в учреждениях Российской империи (Европейская часть России и Сибирь)», 2006; «Нижегородская ярмарочная мечеть – центр общения татарских и зарубежных мусульман», 2006 (в соавторстве с О.Н. Сенюткиной); «Исламские институты в Российской империи: Мечети в европейской части России и Сибири», 2007);
• социальное поведение татарских крестьян Среднего Поволжья в 60–90е гг. XIX в. («Перепись 1897 года и татары Казанской губернии», 2000; серия статей);
• основные механизмы формирования православной конфессиональной группы татарского этноса во второй пловине XVI–XVII в. (серия статей);
• основные общественно-политические мероприятия татар по этноконфессиональной мобилизации в период Первой русской революции 1905–1907 гг. («Национальное движение мусульман ВолгоУральского региона в начальный период революции 1905–1907 гг.», 2019; статьи);
• татарские городские общины ХVIII – начала ХХ в. («Исламские институты в Российской империи: Мусульманская община в СанктПетербурге. XVIII – начало ХХ вв.», 2003; серия статей);
• правительственные межведомственные совещания 1910, 1910–1911 и 1914 гг. как направление по регламентации имперского дискурса в отношении татармусульман и крещеных татар в новых общественно-политических условиях;
• эволюция социально-правового положения крымскотатарского духовенства в конце XVIII – начале XX в. (серия статей и сборник документов);
• развитие национального движения татар в имперский период и его основные этапы («Татарское национальное движение в 1860–1905 гг.», 2014; «Уфимский курултай 1905 года», 2018).

Библиография трудов И.К.Загидуллина.

Ученый подготовил 10 кандидатов наук, среди его учеников 1 доктор наук.

И.К. Загидуллин создал научную школу по изучению социальной истории этносословных и конфессиональных групп татарского народа в Российской империи. Школа также уделяет большое внимание изучению этнокофессиональной политики правительства и социального поведения элит.

И.К. Загидуллин был руководителем ряда проектов по региональной истории.

И.К. Загидуллин награжден медалями Республики Татарстан «В память 1000-летия Казани» (2009 г.) и «За доблестный труд» (2016 г.)

Библиография трудов И.К.Загидуллина.