В анатомических исследованиях (организаторы – Е.Ф.Аристов и П.Ф.Лесгафт) широко применялись экспериментальные методы.

П.Ф.Лесгафт в своих трудах изложил общие закономерности строения тела человека.

В.Н.Тонковым были заложены основы изучения морфологии сосудистой системы – ангиологии (1907), В.Н.Терновский внес большой вклад в изучение нейрологии.

В 1942 г. В.Н.Мурат представил морфологические доказательства адаптационно-трофической функции нервной системы; он и его ученики исследовали проблему источников парасимпатической иннервации желудочно-кишечного тракта за счет блуждающего нерва и нервов крестцового отдела спинного мозга.

Казанскими анатомами Х.Г.Валеевой, М.Т.Ракеевой, Э.С.Валишиным разработана методология изучения нервно-рецепторного аппарата, позволившая исследовать плоскостные соединительнотканные структуры различных органов и систем.

Дальнейшая разработка морфометрических показателей и анализы результатов анатомического эксперимента в 1950–1990-е гг. позволили представить аргументированную картину гемодинамики в сосудах различных органов и систем (Х.Г.Валеева, М.Т.Ракеева, Э.С.Валишин и др.).