Открыт в 1990 г. как учебно-научный центр. Расположен в административном корпусе академии. В фондах музея собраны материалы по истории Казанской медицинской академии — более 3 тыс. единиц хранения; более 1,5 тыс. из них находятся в запасниках, в т.ч. фильмы о ГИДУВе: «Знакомьтесь, ГИДУВ» (1969), «Искусством и человеколюбием, трудом и знанием» (1990), «Вам доверяют люди» (1991).

Материалы экспозиций отражают этапы становления академии. Среди наиболее ценных экспонатов — личные архивы профессоров академии: Р.А.Лурия, Е.М.Лепского, Л.М.Рахлина, А.В.Фаворского, М.О.Фридланда, И.И.Русецкого, В.В.Громова, Н.Н.Лозанова, В.К.Трутнева, В.Л.Боголюбова, А.Н.Мурзина и др.; счётная камера Н.К.Горяева; аналитические весы и микроскоп С.С.Зимницкого; набор инструментов Н.Н.Лозанова; инструменты и уч. пособия (нервные проводящие пути) И.И.Русецкого; личные вещи (стетоскоп, пилотка, плащ-палатка и др.) Л.М.Рахлина, принимавшего участие в спасательной экспедиции челюскинцев. Экспонируются также рентгеновский аппарат РУ-780, грудной электрод дефибриллятора ИД-1-ВИ; фронтовой походный стерилизатор и хирургические инструменты врача В.С.Ефимова времён Великой Отечественной войны. В разделе «Боевые награды» представлены ордена и медали сотрудников академии.

В разделах экспозиции хранятся фотоальбомы, фотоснимки, отражающие различные периоды истории академии и вклад казанских учёных в развитие медицинской науки и здравоохранения. Научная работа музея отображена в рукописях по истории кафедр и клиник, в сборниках трудов, юбилейных изданиях академии («Казанский ГИДУВ (1920–90)», «Казанская государственная медицинская академия. 75 лет (1920–1995)», «Лучевая диагностика и лучевая терапия: Этапы становления. К 70-летию организации кафедр»), других изданиях.

Заведующие музеем: И.М.Муравьёва (с 1990 г.), Г.М.Мингазова (с 2003 г.).

Автор — Ф.Х.Гафурова