Образован 4 августа 1938 г.

Центр – село Ципья.

До 1920 г. территория района относилась к Казанскому уезду Казанской губернии и Малмыжскому уезду Вятской губернии, с 1920 г. – к Арскому кантону ТАССР и Малмыжскому уезду Вятской губернии, с 1921 г. – к Арскому кантону ТАССР, с 1930 г.  – к Тюнтерскому району, с 1932 г. – к Балтасинскому району.

В 1940 г. площадь района составляла 521 км2, численность населения – 24,8 тысяч человек, число сельских советов – 23, населенных пунктов – 51.

В 1956 г. район занимал площадь 524,6 км2, состоял из 15 сельских советов и 49 населенных пунктов.

16 июля 1958 г. Ципьинский район был ликвидирован, территория передана в состав Балтасинского района.