Одно из первых в России специализированных практических учреждений, созданное для борьбы с инфекционными заболеваниями.

Основан в 1900 г. при медицинском факультете Казанского университета как Бактериологический институт по образцу всемирно известного института Л.Пастера в Париже. С 1925 г. Краевой микробиологический институт. В последующие годы название института и ведомственная принадлежность неоднократно менялись: с 1935 г. Казанский институт эпидемиологии и микробиологии, с 1942 г. Казанский НИИ эпидемиологии и микробиологии, с 1952 г. Казанский НИИ вакцин и сывороток, с 1956 г. Казанский НИИ эпидемиологии и гигиены, с 1966 г. – современное название.

В 1965 г. при институте было организовано Казанское предприятие по производству бактерийных препаратов, выпускавшее специализированные иммуноглобулины, препараты крови, бактериальные аллергены и др.; в 1975 г. открыта специализированная поликлиника для населения РТ и Поволжья по диагностике и лечению инфекционно-аллергических заболеваний.

В составе института лаборатории: по разработке аллергенов; микробиологии, иммунологии и биохимии; природно-очаговых инфекций; консультативно-диагностическая поликлиника, научная библиотека.

К первому поколению ученых института относятся: бактериолог-иммунолог В.А.Барыкин, иммунолог П.Ф.Здродовский, офтальмолог В.В.Чирковский; С.С.Зимницкий, разработавший в 1922 г. метод исследования функции почек (проба Зимницкого); В.М.Аристовский, фундаментальные исследования которого были посвящены проблемам сыпного и возвратного тифов, сифилиса, туберкулеза, инфекционной аллергии, усовершенствованию бактерийных препаратов.

Институт работал и в годы революции, Гражданской войны и послевоенной разрухи, занимался ликвидацией инфекций, свирепствовавших в Поволжье. Были разработаны и выпущены противодифтерийная и противоскарлатинозная сыворотки, вакцины: антирабическая (1917 г.), против холеры и крысиного тифа (1919 г.), скарлатинозная (по Габричевскому, 1922 г.), стафилококковая и стрептококковая (1924 г.). Исследования казанских ученых имели и прикладные эпидемиологические аспекты: решались проблемы краевой эпидемиологии натуральной оспы, дифтерии, скарлатины, бактериальной дизентерии, брюшного тифа. В 1930-е гг. в Татарии была ликвидирована оспа.

В годы Великой Отечественной войны деятельность института была направлена на профилактику эпидемий. Выполнялись работы по краевой эпидемиологии сыпного тифа и дифтерии (А.Э.Озол). С 1941 г. в институте работали специалисты Центрального института эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи (Москва, руководитель – В.Л.Троицкий) и ленинградские ученые, эвакуированные в Казань. Совместно разработаны оригинальный метод получения сыпнотифозной вакцины (Т.М.Кокушкина, П.Н.Кашкин), противогангренозные комплексные сыворотки и освоено их производство (И.Е.Алатырцева), дизентерийная подкожная вакцина, дивакцины и пентавакцины (В.Л.Троицкий, А.М.Полтинникова, Г.Г.Ахмадуллина, К.С.Зобнина). В 1943 г. для предупреждения и лечения инфекционных заболеваний было выпущено 6,5 млн человеческих доз бактерийных препаратов (17 наименований).

В 1950–1980-е гг. для профилактики и лечения острой и хронической дизентерии было освоено производство адаптированного к местным штаммам дизентерийного бактериофага, производство высококачественного дифтерийного анатоксина, разработан интраназальный метод иммунизации против дифтерии, столбняка, коклюша. В начале 1960-х гг. А.Д.Адо и И.Е.Алатырцевой было создано новое научное направление – изучение инфекционной аллергии, в 1964 г. заработала первая в СССР научная лаборатория по созданию отечественных диагностических бактериальных аллергенов, в 1975 г. открыта специализированная поликлиника.

В 1977 г. в институте создана лаборатория иммунологии и биохимии по изучению бактериальной аллергии. Были выявлены и изучены природные очаги клещевого энцефалита в Поволжье, установлено существование природных очагов геморрагической лихорадки с почечным синдромом, разработан и получен иммуноглобулин (В.С.Потапов).

Была составлена документация на 20 наименований аллергенов (руководитель – В.М.Лукашков); получен лекарственный препарат из крови – фибронектин и на его основе глазные капли (руководитель – О.Д.Зинкевич); разработана иммуноферментная тест-система для количественного определения антител к антигенам условно патогенной микрофлоры.

Налажен выпуск стандартных вакцин для реакций фагоцитоза, НСТ-тестов, широко применяемых на практике.

В институте продолжаются исследования по традиционным тематикам:

  • разработка диагностических и лечебных препаратов (аллергенов из бактерий и грибов, иммуноглобулинов), иммуноферментных систем для определения антигенов и антител,
  • усовершенствование методов диагностики инфекционных заболеваний,
  • изучение вопросов эпидемиологии и микробиологии кишечных и природно-очаговых инфекционных заболеваний, разработка мероприятий по их снижению.

В институте работали известные отечественные ученые, среди них: Н.М.Любимов, М.Я.Капустин, Ф.Я.Чистович, Б.А.Барыкин, П.Ф.Здродовский, Н.П.Кашкин, А.Д.Адо и др.