Была образована 16 августа 1918 г.

Командующие: П.А.Славен, Ж.К.Блюмберг, М.Н.Тухачевский, Г.Х.Эйхе. Начальники штаба: А.К.Андерсон, П.И.Ермолин, Я.К.Ивасиов, Г.Я.Кутырев.

В состав Пятой армии входили 1-я Смоленская, 4-я Петроградская пехотные, 2-я, 5-я, 24-я, 25-я, 26-я, 27-я, 30-я, 31-я, 35-я, 51-я, 59-я, 62-я стрелковые, 13-я, Сводная кавалерийские дивизии.

В 1918 г. – начале 1920 гг. вела боевые действия против Чехословацкого корпуса, Народной армии Комуча, Белой армии адмирала А.В.Колчака.

В ходе Казанской операции 5-я армия совместно с Арской группой 2-й армии Восточного фронта и во взаимодействии с Волжской военной флотилией 10 сентября 1918 г. освободила Казань.

Осенью–зимой 1918 г. армия наступала в направлении Бугульмы, освобождала Уфу (декабрь 1918 г.).

В марте–апреле 1919 г. под ударами колчаковских войск 5-я армия отступила из района Уфы в район западнее Бугуруслана и Бугульмы.

Во время контрнаступления войск Восточного фронта участвовала в Бугурусланской операции (апрель–май 1919 г.).

В июле 1919 г. – январе 1920 г. вела бои за города Златоуст, Челябинск, Петропавловск, Омск, Томск, Красноярск.

15 января 1920 г. Восточный фронт был расформирован, 5-я армия передана в непосредственное подчинение Революционного военного совета Республики.

Формирование и подготовку резервов из татар и башкир осуществляли подотдел формирования татаро-башкирских частей (май–октябрь 1919 г.) и татаро-башкирский батальон 1-го запасного полка (апрель–декабрь 1919 г.).

В 1919–1920 гг. при политотделе 5-й армии действовала мусульманская секция, издавалась газеты «Кызыл яу».