Длина 22,2 км, площадь бассейна 127,2 км2. Исток в 0,6 км к западу от поселка совхоза «Ныртинский» Кукморского района, устье в 1 км к юго-западу от деревни Три Сосны Сабинского района.

Абсолютная высота истока 200 м, устья – 94 м. Лесистость водосбора 35%.

Нысе имеет 7 притоков длиной от 0,8 до 6,8 км. Густота речной сети 0,37 км/км2. Питание смешанное, с преобладанием снегового. Модуль подземного питания 0,5–1 л/с·км2. Гидрологический режим характеризуется высоким половодьем и очень низкой меженью. Средний многолетний слой годового стока в бассейне 140 мм, слой стока половодья 109 мм. Весеннее половодье, за время которого проходит до 80% годового стока, начинается обычно в конце марта. Замерзает Нысе в середине ноября. Средний многолетний меженный расход воды в устье 0,13 м3/с.

Вода мягкая (1,5–3 мг-экв/л) весной и жесткая (6–9 мг-экв/л) зимой и летом. Общая минерализация 200–300 мг/л весной и 700–1000 мг/л зимой и летом.

В бассейне Нысе 2 пруда суммарным объемом 1,5 миллиона м3. Водные ресурсы используются для орошения.