Расположено на высокой левобережной террасе реки Волга, в 1 км к западу от села Никольское Лаишевского района, южнее озера Архиерейское.

Находится в заболоченной и заросшей кустарником ложбине стока, вытянутой в южном и юго-восточном направлении от озера Ковалевское, соединяющейся с рекой Меша вблизи села Нармонка.

Площадь водного зеркала 3,92 га. Объем около 100 тысяч м3. Длина 507 м, максимальная ширина 123 м. Средняя глубина 3 м, максимальная глубина 4 м. Происхождение озерной котловины карстовое. Форма вытянутая. Берега низкие, пологие. Прибрежная зона заболочена. Северо-восточная часть заросла водно-болотной растительностью.

Ранее Чёрное озеро являлось частью Большого Никольского озера, которое было одним из самых крупных водоемов Приказанья (имело вытянутую форму длиной около 6 км, площадь водного зеркала 223 га, шириной от 65 до 830 м).

К середине XX века Большое Никольское озеро постепенно уменьшилось в размерах в результате выноса песчано-глинистых отложений из прилегающих с юго-запада овражно-балочных систем, последующего заиления и зарастания. Единый водоем распался на несколько более мелких озер, в том числе Чёрное озеро.

Из озера в сторону реки Меша в период весеннего половодья вытекает река, которая служит дренажным каналом для большей части Волго-Мешинского междуречья.

Дно озера покрыто водорослями, отчего вода кажется черной (отсюда название).

Имеются заросли кубышки желтой.

Памятник природы РТ (1978).