Открыт в 1930 г. на базе медицинского факультета Казанского университета, созданного в 1814 г. как врачебное отделение (с 1835 г. – медицинский факультет), с 1994 г. – современное название. В 1966–1994 гг. носил имя С.В.Курашова. Учреждение удостоено ордена Трудового Красного Знамени.

Первоначально состоял из 2 факультетов: лечебного и санитарно-гигиенического, затем открыты новые факультеты: в 1932 г. – педиатрический, в 1956 г. – стоматологический (на основе Казанского стоматологического института), в 1975 г. – фармацевтический, в 1991 г. – социальной работы, в 1993 г. – последипломного образования, в 1994 г. – менеджмента и высшего сестринского образования, в 2014 г. – по работе с иностранными студентами и медико-биологический. В 1984–2001 гг. работал вечерний факультет. В составе факультетов действуют 61 кафедра.

В разные годы в вузе преподавание и научно-исследовательская работа велись по всем основным дисциплинам: как терапии (Н.К.Горяев, А.И.Бренинг, А.Б.-Г.Терегулов, В.И.Катеров, З.И.Малкин, К.А.Дрягин, И.Л.Билич, С.И.Щербатенко, В.Е.Анисимов, Я.М.Милославский, Р.Ш.Абдрахманова, В.Ф.Богоявленский, И.А.Латфуллин, Н.Б.Амиров, И.Г.Салихов, В.Н.Ослопов, А.С.Галявич, Р.А.Хабиров), инфекционным болезням (Б.А.Вольтер, А.Е.Резник, В.Х.Фазылов), иммунологии (В.Н.Цыбулькина), дерматовенерологии (Н.Н.Яснитский, Г.Г.Кондратьев, Р.З.Закиев), офтальмологии (В.Е.Адамюк, А.П.Нестеров, Н.Х.Хасанова), оториноларингологии (В.К.Трутнев, Н.Н.Лозанов, Л.Г.Сватко, В.И.Галочкин), фтизиатрии (Б.Л.Мазур, Ф.Т.Красноперов), физиотерапии (А.Г.Ибрагимова, Ю.Е.Микусев), фтизиопульмонологии (А.А.Визель), эндокринологии (В.В.Талантов), психиатрии (М.П.Андреев, Д.М.Менделевич, К.К.Яхин, В.Д.Менделевич), неврологии (Л.И.Омороков, Я.Ю.Попелянский, М.Ф.Исмагилов, Т.В.Матвеева, В.А.Исанова, В.И.Данилов, Э.И.Богданов, Д.Р.Хасанова), хирургии (А.В.Вишневский, Н.В.Соколов, С.М.Алексеев, И.В.Домрачев, Б.Г.Герцберг, И.Ф.Харитонов, В.Н.Шубин, Р.А.Вяселев, В.Х.Фраучи, Н.П.Медведев, В.Г.Морозов, А.А.Агафонов, Г.М.Николаев, И.А.Салихов, И.В.Клюшкин, Д.М.Красильников, С.В.Доброквашин), нейрохирургии (Х.М.Шульман), педиатрии (В.К.Меньшиков, Е.М.Лепский, А.Ф.Агафонов, Ю.В.Макаров, Е.Н.Короваев, П.Н.Булатов, К.А.Святкина, Н.П.Кудрявцева, Е.В.Белогорская, А.Г.Шамова, А.П.Пигалов, Л.К.Фазлеева, О.И.Пикуза, В.П.Белогорский, В.А.Анохин, С.Я.Волгина), акушерству и гинекологии (В.С.Груздев, И.Ф.Козлов, Х.Х.Мещеров, П.В.Маненков, Г.М.Шарафутдинов, З.Н.Якубова, Б.Г.Садыков, Л.А.Козлов, А.А.Хасанов, И.Ф.Фаткуллин), детской хирургии (М.Р.Рокицкий, А.А.Ахунзянов, П.Н.Гребнев), рентгенологии (М.И.Гольдштейн, М.Ф.Мусин), нормальной анатомии (В.Н.Терновский, В.Н.Мурат, Х.Г.Валеева, А.Г.Коротков, Э.С.Валишин), патологической анатомии (В.А.Добрынин, Н.Ш.Шамсутдинов, С.Б.Петров, С.В.Петров), гистология (А.Н.Миславский, Г.И.Забусов, Э.Г.Улумбеков, Ю.А.Челышев, В.В.Валиуллин), физиологии (А.В.Кибяков, И.Н.Волкова, Х.С.Хамитов, А.Л.Зефиров, Е.М.Волков), патофизиологии (А.Д.Адо, М.А.Ерзин, И.М.Рахматуллин, М.М.Миннебаев, А.М.Девятаев, Ф.И.Мухутдинова), гигиене (В.В.Милославский, А.И.Смирнов, В.П.Камчатнов, А.Т.Гончаров, А.М.Хакимова, М.М.Гимадеев, Н.Х.Амиров, А.В.Иванов, Ш.Ю.Якупов, А.Б.Галлямов, Р.Я.Хамитова, А.А.Имамов), общей гигиене (М.Х.Вахитов, Т.Д.Эпштейн), эпидемиологии (А.Э.Озол, В.И.Качурец, М.Ш.Шафеев), микробиологии (З.Х.Каримова, Н.Ф.Амфитеатрова, О.К.Поздеев, Л.Т.Мусина), биохимии (В.А.Энгельгардт, Д.М.Зубаиров, Р.И.Литвинов, Р.Ф.Байкеев), стоматологии (И.М.Оксман, Г.Д.Овруцкий, Л.А.Кольцова, Х.М.Сайфуллина, М.З.Миргазизов, И.И.Гиниятуллин, Р.З.Уразова), фармакологии (И.В.Заиконникова, И.А.Студенцова, Д.А.Валимухаметова, Р.С.Гараев, Л.А.Поцелуева, Р.Х.Хафизьянова, А.З.Байчурина, С.Н.Егорова, А.У.Зиганшин), урологии (Э.Н.Ситдыков, М.Э.Ситдыкова), нефрологии (О.Н.Сигитова), анестезиологии (В.Ф.Жаворонков), нейрорентгенологии (И.И.Камалов), травматологии (Р.А.Зулкарнеев), медицинской биологии (Г.И.Полетаев, В.В.Семенов), судебной медицине (Г.М.Харин).

В 2018/2019 учебном году в вузе насчитывалось свыше 6 тыс. студентов, более 420 преподавателей, в т.ч. 120 докторов и около 300 кандидатов наук. За период существования учебного заведения подготовлено более 30 тыс. специалистов, среди них – министры здравоохранения СССР, РСФСР и РФ (Н.А.Семашко, З.П.Соловьев, С.В.Курашов, А.А.Баранов, А.Д.Царегородцев), 3 академика и 3 члена-корреспондента РАН (А.А.Баев, К.М.Быков, А.Д.Сперанский, Н.Г.Колосов, Н.А.Миславский, Б.И.Лаврентьев), 19 академиков и 13 членов-корреспондентов АМН (А.Д.Адо, В.М.Аристовский, А.В.Вишневский, А.А.Вишневский, П.Ф.Здродовский, В.И.Иоффе, М.С.Малиновский, И.П.Разенков, А.В.Снежневский, П.Г.Сергиев, Н.А.Семашко, В.В.Чирковский, Н.Х.Амиров, Г.П.Зарубин, А.В.Кибяков, Б.В.Огнев, М.В.Сергиевский, А.Г.Сухарев и др.); 3 академика и 13 членов-корреспондентов АН РТ (Д.М.Зубаиров, М.К.Михайлов, Э.Н.Ситдыков, Р.С.Гараев, М.М.Гимадеев, С.В.Мальцев и др.).

Печатные издания: журналы «Казанский медицинский журнал» (с 1901 г.), «Неврологический вестник имени В.М.Бехтерева» (с 1993 г.), «Вестник современной клинической медицины» (c 2008 г.); газета «Казанский медик» (с 1934 г.).

Работают Музей истории университета (с 1984 г.), музеи кафедр нормальной анатомии, патологической анатомии, нормальной физиологии, акушерства и гинекологии, а также музеи А.В.Вишневского, Л.О.Даркшевича.

Директора, ректоры: С.М.Курбангалеев (1930–1931 гг.), А.А.Диковицкий (1931–1932 гг.), И.С.Алуф (1932–1935 гг.), М.И.Аксянцев (1935 г.), С.Б.Еналеев (1935–1937 гг.), М.В.Нежданов (1937–1941 гг.), С.В.Курашов (1941–1942 гг.), Г.Ф.Тихонов (1942–1944 гг.), В.С.Исупов (1944–1945 гг.), М.Ф.Мережинский (1945–1947 гг.), Р.А.Вяселев (1947–1963 гг.), Х.С.Хамитов (1963–1989 гг.), Н.Х.Амиров (1989–2009 гг.), А.С.Созинов (с 2009 г.).